Востановление после антибиотиков

Моей дочери 3,5 месяца, когда ей было 2 месяца она  переболела острым пиэлонефритом,кололи Цефтриаксон 2 недели. Уже прошел целый месяц после антибиотиков,пропили  множество лекарств  малышка на грудном вскармлевании а анализы твердят  что лактобактерий оооочень мало. Что нам подскажете?Спасибо!